Studia prowadzone przez Instytut Zdrowia Publicznego Wydziału Nauk o Zdrowiu wspólnie z Wydziałem Zarządzania i Komunikacji Społecznej, to oferta skierowana do osób pragnących w przyszłości związać swoją karierę zawodową z rozwijającym się, perspektywicznym sektorem ochrony zdrowia, na wielu pozamedycznych stanowiskach pracy. Jest to pierwszy tego typu program na Uniwersytecie Jagiellońskim. Cechą szczególną kierunku jest jego międzywydziałowość, skutkująca interdyscyplinarnością i całościowym podejściem do problemów natury organizacyjnej, zarządczej i ekonomicznej, występujących w ochronie zdrowia. Kierunek zarządzanie w ochronie zdrowia prowadzony jest w Instytucie Zdrowia Publicznego wspólnie z Wydziałem Zarządzania i Komunikacji Społecznej. Instytut Zdrowia Publicznego jest najstarszą w Polsce placówką edukacyjną, prowadzącą nieprzerwanie kształcenie w zakresie zdrowia publicznego, przedmiotem zainteresowań naukowych pracowników instytutu są zagadnienia związane z pozamedycznymi aspektami opieki zdrowotnej. Zarządzanie w ochronie zdrowia jest odpowiedzią na stale występujące wysokie zapotrzebowanie rynku pracy na absolwentów przygotowanych do profesjonalnego wspomagania procesu zarządzania podmiotami leczniczymi, zarządzania finansami w różnych instytucjach na poziomie lokalnym i krajowym w sektorze ochrony zdrowia, kierowania, administrowania i koordynowania opieką zdrowotną w podmiotach leczniczych oraz jednostkach samorządu terytorialnego.

Już w trakcie studiów studenci odbywają praktyki, których celem jest zapoznanie z charakterem pracy obowiązującym w instytucji, w której praktyka się odbywa (szeroko rozumiany sektor ochrony zdrowia, np.: instytucje centralnej administracji publicznej z obszaru ochrony zdrowia i polityki społecznej, jednostki samorządu terytorialnego, Narodowy Fundusz Zdrowia, instytucjach badawczo-rozwojowych i edukacyjnych, organizacje pozarządowe, media zajmujące się tematyką zdrowotną, organizacje międzynarodowe zajmujących się zdrowiem, kancelarie prawne czy instytucje badawcze). Studia przygotowują przyszłych pracowników jednostek funkcjonujących w sektorze ochrony zdrowia i instytucjach z nim współpracujących, którzy będą potrafili zastosować różnorodne narzędzia organizacyjne, zarządcze, ekonomiczne, prawne i komunikacyjne do poprawy efektywności i skuteczności działania różnych podmiotów sektora ochrony zdrowia, a co za tym idzie całego systemu zdrowotnego. Przygotowują do podjęcia pracy na niemedycznych stanowiskach samodzielnych i wykonawczych w instytucjach szeroko rozumianego sektora ochrony zdrowia ze szczególnym uwzględnieniem zadań wymagających definiowania i rozwiązywania problemów zarządczych, ekonomicznych, organizacyjnych i komunikacyjnych.